fold change就是样本之间代谢物浓度的差异倍数，用KO的浓度除以WT即可。小于1就是浓度降低了，大于1就是升高。
经常还会用到log2 fold change，意思是取log2，这样便于分析。

比较形象的解释：基因组学反映了什么是可以发生的，转录组学反映的是将要发生的，蛋白质组学指出了赖以发生的， 代谢组学反映已经发生的。

基因组，转录组，蛋白组有什么区别，相互关系是咋样的
组学omics,研究的是整体.按照分析目标不同主要分为基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学.基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,

物质的量是描述物质的数量的性质，只要组成固定即可描述。只要代谢物组成固定或相对固定，也可同样描述。

不同成熟条件，大豆里面的代谢物成分理论上应该是不一样的，这个不一样是两个方面，其一是有些代谢物是新出现的或者是在这个成熟点上是没有的；其二这些代谢物都有，只是在表达量上有区别。代谢组的目的就是检测这些不同成熟点上大豆里面所有的代谢物成分，如果实验多设计了几个成熟点，代谢组就能够把这些成熟点上表达差异的代谢物给鉴定出来。
回到你的第一个问题，如果在达到成熟特性时，根据自己的研究经验，可能应该有某一些特殊的代谢物会表达，比如某种脂类，这样是不是会比较香，口味也比较好，也可能也会出现一些其他的一些代谢物，一些是我们一眼就可以看出是类似于“看家代谢物”一样很常见，还有一些是的确没有看到过比较少见的，这个时候就应该去查文献，发现总结这些代谢物为什么会出现在里面，是不是它们的出现会和我们常见的成熟大豆里面应该出现的代谢物有某些关系，这个是一个探索的过程。如果你有几个不同的成熟点的话，就可以分析哪些代谢物是随着这个时间点变化的，是一直在上升表达还是在下降表达，或者是先上升后下降还是其他的，你把这些变化特点和干酪的形状（比如硬度，口味，保存时间.......）联系起来分析就可以了。
第二个问题，代谢组做完以后，可以做个PCA的主成分分析，简单的说通过这个分析是不是可以找到一个代谢物的group，通过这个group可以把你之前试验设置的几个不同成熟时间点给区分开，如果可以区分开，那就说明这个group比较有代表性。如果在经过一系列的分析，以后如果给你一个未知成熟时期的干酪，那通过检测这个group的情况就能出不判断成熟时期了。

基因组学:研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。该学科提供基因组信息以及相关数据系统利用，试图解决生物，医学，和工业领域的重大问题。

蛋白质组学:蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识

代谢组学:是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式

参考这个公众号的介绍
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MDU3NjMxNg==&tempkey=FLKG1g0KJTc7ms2pLe%2FSIR8BWnpaDDq2gSzoIGoo%2FQ88kviAeu3LHoSIeh4cIMLmd07eoB%2FAvw8rUFGXj6g2emwYnhIvWjlz4DUoK2hEwjU6dDLOiyywtDGLSVwj8i976l3aWBWkvFdaT1CXYNOCTw%3D%3D&chksm=6bb729515cc0a04799f7944e1997727aa811e74797dadf34a38ca5d732e5dd4fb0f2dda5aa12#rd