首先跟张居正生前的做法有关系，要知道张居正在掌权期间，他的口碑并不是很好，甚至可以用差来形容。不为别的因为张居正做事非常的嚣张跋扈，不把任何人放在眼里，就比如说当时发生了这么一件事情，张居正的父亲死后，朝中有一个官员因为私事没有参加张居正父亲的葬礼。

于是张居正记恨在心，在之后随便找了一个理由，把这名官员从朝中踢了出去，甚至还觉得这样做不过瘾，在后续接连打压了和这名官员走得很亲近的其他的官员，但是这些官员敢怒不敢言，毕竟张居正当时的权力非常的大，就连万历皇帝都要卖他一个面子，他们这些小官员就更没有机会在张居正的面前讨说法。

其次就是因为张居正的地位太高了，甚至从某种程度上来说，已经威胁到了万历皇帝的统治，但是又不能明面上把他杀死，因为那个时候的明朝也很需要他，毕竟张居正的能力非常的强，所以万历皇帝只能在他死后把这个场子找回来。

此外就是万历皇帝对张居正忍无可忍了，并且在张居正死后也有想着把朝中所有的权利，都聚集在自己的手上，但是朝中也有其他的大臣在盯着万历皇帝，如果他不采取一点雷霆手段的话，这些大臣是不会服气的，而且贸然的行动甚至还会起到相反的效果，所以万历皇帝决定拿张居正开刀，可以起到杀鸡儆猴的作用。

张居正落得这样的下场，原因大抵有三：一是贪污问题，不管是他自己贪的，还是兄弟子侄贪的，都要算到他的头上；二是得罪了太多的人，他在位的时候，实行新政，得罪的人太多了；三是万历帝也恨他，因为他损害了对方的帝王尊严。

先说贪污问题，一个如此大的官，必然逃脱不了这个问题，就算他本人再怎么清廉，在明朝的那种制度下，其兄弟子侄也可以利用他的权力和地位去寻租，这一点，想必张居正本人也是很清楚的。但他显然没有制止这种行为，所以他死后，光是直接抄出来的家产，就多达万两黄金，此外还有白银十多万两。

至于得罪人，这是肯定的，因为他在位的时候，推行新政，既然涉及到了改革，就必然会触及一些旧利益集团。中国历史上，搞改革的人就没有几个有好下场的，比如战国时候的商鞅、吴起，就是典型的例子。张居正在位的时候，那些人或许不敢造次，然而等到他一死，情况自然就不同了。这些人一旦联合起来，就算万历帝想保他一家，恐怕也会无能为力。

事实上，万历帝根本就不愿意保他一家老小，因为他对张居正本身就有成见。这个人固然是个大功臣，可正因为功劳大，才会抢了皇帝的风头。更何况，万历年轻的时候，张居正就做过帝师，估计也没少管教，后来执政的时候，也时常摆出老师的架子，这就很容易让万历生起嫉恨之心。综合以上这三点原因，张居正落得个被抄家的下场，实在是再正常不过了。

因为张居正辅政期间，大权独揽，使万历君王的君权受到压制。因此，居正死后，万历君王就开始行使自己手中的君权进行报复，这是封建君权制度下作为臣子的悲哀。

明神宗在年仅十岁继位，张居正担任首辅，受先帝托孤嘱托，张居正不仅担负起辅佐朝政的责任，同时也日常教导神宗。因此，张居正与神宗的关系不仅是君臣，也是师生，更类似于父子。神宗对居正均以“先生”相称，朝廷大小事务均遵从居正的意志。

少年时期的神宗对居正相当恭谨、顺从，但神宗作为武宗的子孙，血液里流淌着桀骜不驯、偏执任性的个性。长大成人后，就逐渐有了自己的意志，对居正独揽乾纲的局面慢慢滋生出不满、怨恨，这就为居正死后遭到清算报复埋下了祸根。

万历七年，神宗和居正就在外戚封爵是否可以世袭这一问题上意见不统一。神宗欲封皇后之父王伟永年伯。居正认为，按照明朝祖制，公、候、伯爵除非有军功，一般不能滥封。居正同意将王伟进封伯爵，但伯爵之位只能及身为止，不能世袭。这让神宗很不高兴，虽然仍按照居正意见照准，但君臣关系正在发生微妙的变化。

万历八年，又发生一件事使神宗和居正的关系间隙进一步加大。此时已十八岁的神宗在太监撺掇下出宫寻求消遣。在宫外喝酒听戏时，有个小内监不识趣惹怒了神宗，神宗便命人鞭挞该名小内监，并割下其头发实行割发代首。宿醉回宫后的神宗受到其生母慈圣皇太后的严厉申斥，太后命居正代神宗拟罪己诏，并将撺掇神宗出宫的太监充军，对神宗身边内侍进行整顿。此次事件中，直接将居正推向了神宗对立面，神宗作为失败者，内心惭愤之情也转嫁到居正身上。

在封建君权制度下，居正即使为国为社稷鞠躬尽瘁，但得罪了手握皇权的君王，自然难以善终。

张居正为大明鞠躬尽瘁，死后却被万历帝抄家的原因在于万历帝对他是没有多少好感的，万厉帝并不喜欢他，其次就是张居正并不是一个清官，说他是一个贪官也并不为过，而且他贪污的数量并不在少数，当然他在自己当政的时候，得罪了很多人也是其中的重要原因之一，这些人在他死后自然会对他的家人进行报复。

一、万历帝相当的不喜欢他。在当时皇权与宰相权是两个相依相克的两种力量。当皇权比较弱的时候就需要有一人之下，万人之上的宰相权力来压制，当然一人之下，万人之上的宰相权力过于强大的时候，皇帝就会嫉妒和猜疑。当时神宗上位的时候仅仅只有十来岁左右，为了稳定国家就要借宰相的权力，当然这里会有神宗母亲的推崇。对于张居正他们母子两人都很尊敬和依赖，对于张居正所要求的各种要求只要不会很过都会答应的。所以当时张居正对少年时的神宗很严厉，神宗的什么事情都要管一下，导致在神宗的心里留下了不好的阴影。从敬佩，尊敬到讨厌的地步方向去。

二、张居正贪污、贪财。神宗听说很多财宝和珠宝都被当做礼物送给了张先生，之后神宗的母亲就说就算抄家都不可能拿到全部，到时候被全部转移之后可能会什么都拿不到，于是他们就等待着机会。在此之外还有张先生一个人很大，没有后代，也是他失败的那么快的原因。他喜欢把他捧在心里的人，不喜欢敢实话实说的人，所以当神宗要把它清除的时候，一帮墙头草都倒向神宗那边。

其中更加可笑的是当时被张居正骂的，被朝廷打至残废的邹元标拖着瘸腿为张先生叫冤和推行新政，然而最终还是没有救到张居正的命。