在蒙古各部中，卫特拉蒙古中的准噶尔部是清朝最大的敌人，其中清朝与它之间的战争，甚至是败多胜少。清朝历经三代帝王，用了将近70年的时间，最终康熙御驾亲征，才得以消灭准噶尔汗国，实现了对西域的征服。

准噶尔在当时技术先进，准噶尔北临沙俄，已经接触到了西方的先进军事科技，在技术层面已经完全碾压清军。这导致清军在相同数量的对峙中几乎占不到任何优势。俄罗斯向准噶尔汗国提供了许多武器装备，但俄罗斯不愿意让清朝灭亡。当准噶尔和清朝都受到伤害时，是他采取行动的最佳时机。如果清朝不能打败准噶尔并被拖垮，那将是中华民族的灾难。俄罗斯不会错过一举消灭清朝的机会，从而获得他想要的出海通道。

准噶尔在这个阶段完成了蜕变。准噶尔经过了噶尔丹以及策妄阿拉布坦等的经营，已经不再是传统的游牧政权，准噶尔已经完成了卫特拉蒙古的统一，并以西域为中心发展成一个综合实力强悍的集权制国家，这使得清朝平定准噶尔难度骤增。

清朝方面的军队开始走向衰落也是一个重要原因。自1644年清军入关以来，清朝赖以起家的八旗劲旅已经不可避免地走向衰落。到三藩之乱时，很多八旗子弟已经上不得马，拉不开弓。昔日“满万不可敌”的八旗军队，已经走向荒废，清朝不得不倚靠绿营和蒙古军队平定边疆。

综上所述，清朝历经70年才灭绝了这个心腹大患，1755年，清朝终于发动对准噶尔汗国的灭国之战，康熙不愧为一代大帝。

原因有二：

准噶尔汗国位处约现在的新疆地区，中原士兵无法适应那里的环境。那边很多沙漠地带，生活在中原的人们首先要适应高原环境，其次战斗的时候还要适应脚下松软的沙漠土壤，十成战斗力无法发挥出6成。而准噶尔汗国的当地士兵，由于世代居住此地，自然不会被当地的特殊环境所影响。

再加上准噶尔汗国那边昼夜温差很大，白天很热，晚上很冷，对军队士兵的体力消耗十分的大，在战斗的时候很难全力应对敌人。而作为主帅，又由于不熟悉当地的地形，很难做出正确的对敌之策，往往陷入被动的局面。

而且那边离中原太过遥远，后勤很难跟得上，战线拉的过长，不适合长期作战。但是原本就不熟悉准噶尔汗国的环境，敌人进退自如，而自己却摸不着敌人的尾巴，很难速战速决，只能被迫长期作战。可以说是以己之弱对敌之强，那么自然很难灭掉准噶尔汗国了。

准噶尔汗国并不是人们想象中只是偏居一偶的小国，相反，他们是个占地达400多万平方公里的国家，与沙俄也就是如今的俄罗斯接壤，曾多次击退沙俄的侵犯，单这一项就可以证明其国力的强盛。

而且当地民众大多是属于游猎民族，人们可以说是生活在马背上，本身的身体素质极其强硬，面对敌人来犯，任何一个平民百姓骑上战马，拿起弓箭都是一个合格的士兵。再加上在前期准噶尔汗国本身也很注重军队的训练，经常组织军事训练活动，以保证国家兵力的强盛。

在这种情况下，清朝想要灭掉准噶尔汗国并没有想象中的那么容易。若不是最后准噶尔汗国内部出现问题，出现了内乱，可以说想要统一准噶尔汗国或许还要迟上几十年。

严格来讲，清朝与准噶尔汗国之间的战争进行了将近整整80年，历经了三代皇帝，之所以这么难，因为清朝和准噶尔汗国之间，实力不相上下，当时都是亚洲地区的大国。

准噶尔汗国是由蒙古人的一个部落首领噶尔丹建立起来的，汗国建立后，东征西战，不断扩展，侵犯清朝的势力范围。这样一个巨大的威胁，对于清朝统治者来说，是绝对不允许出现的。一代雄主康熙大帝，决定征讨准噶尔丹。于是，大清和准格尔汗国长达将近百年的你死我活的较量，自此开始了。

准格尔汗国全盛时期，统一了天山南北，占据了内外蒙古，是一个称霸中亚地区的大国。清朝统治者进入中原后，也雄心勃勃要开疆拓土，消除边疆隐患。两国交战后，很长时期内都后互有胜负。但是准噶尔汗国内斗不断，国力不断衰弱。到了乾隆帝时期，乾隆抓住准噶尔汗国内耗无暇外顾的机会，发动大军继续征伐，一战而定。

内忧加上外患，准噶尔汗国——这个称雄中亚的帝国就此灭亡。为了彻底斩草除根，乾隆下令屠戮准格尔部青壮年，妇孺送入内地赏给士兵，准噶尔部从文化和民族上彻彻底底的消失了。而西域因为故土新归，被称作新疆。

所以可能很多人不知道，我们现在从汉代就开始统治的新疆，在清代很长的一段时间里，这里存在过一个文化和民族上与我们完全不同的国家，而这个国家在与清朝长达八十年的战争中，彻彻底底的消失在了历史的长河中。