1、“祖国”与“国家。按照这种看法，“国家”是一个“协议”这是现代政治学家普遍接受的观点:国家是规定政府怎样构成和怎样行使权力的法律体系或政治制度，而政府是依照这些法律或制度建立的机构。
2、犯错误的权利。洛克提出的基本原则很有说服力。但是，在说明正义战争的胜利者对被征服地区没有统治权的时候，他反复强调，原因是被征服地区的人民并不支持不正义的统治者。
3、没有权利犯的错误。人可以犯自己有权利犯的错误，但不能犯自己没有权利犯的错误。
4、两种不同的权力。在洛克之前，霍布斯提出，自然状态就是战争状态:“在没有使人敬畏的公共权力时，人们处于战争状态。这是每个人对每个人的战争。

《政府论》（Two Treatises of Government）：《政府论》上、下篇成书于1689年到1690年，是洛克最重要的政治学著作。《政府论》的第一篇是对菲尔默的《先祖论》的反驳。洛克极力并有效地驳斥了菲尔默的君权神授的主张，认为“人是生而自由的”。通常认为，在第二篇中，洛克试图替光荣革命辩护，但根据拉斯莱特的考证，《政府论》发表之时，光荣革命尚未发生，因此这部著作是在呼唤一场革命而不是为已经发生的革命辩护。（<The book Two Treatises of Government isbelieved to be written in support and justification of the Glorious Revolutionof 1688 in England. Political Scientists agree that Two Treatises of Governmentwas in actuality a "demand for a revolution", very radical for the17th Century.）。洛克主张，政府的权威只能建立在被统治者同意的基础之上（government with the consent of the governed），并且主张社会契约论，当统治者昏庸无道，实行专制和独裁的暴政的时候，人民有权推翻暴政，废除先前订立的契约并重新订立契约。
《政府论》的主要思想：第一，对菲尔默君权神授的批判。第二，对国家和政府起源的探究，政府的唯一目的就是保护公民的财产（life，libertyand estate，生命、自由和财产）。第三，分权思想：洛克将权力划分为立法权、行政权、对外权。分权的目的在于以权力限制权力。第四，人权保障思想。第五，有限政府思想，第一次提出宪政理论。第六，公民个人自然权利的神圣性和优先性。个人拥有三项基本自然权利：生命权、自由权和财产权。
洛克提出了一套与霍布斯的自然状态（state of nature）不同的理论，洛克认为，自然状态是一种理性状态，受自然法的统治，也就是理性的统治。在自然状态中，人们受理性支配而生活在一起，自然法对它起着支配作用；而理性，也就是自然法，教导着有意遵从理性的全人类。
由于自然状态有着不可克服的缺陷，再加上在实践上自然法经常被忽略，因此政府的保护是必要的，然而政府的统治也必须经过被统治者的同意，这样的统治也只有在一个全体的法律体制下才能表现出来。因此所有的政府都只是人民所委托的代理人，当代理人背叛了人民时，政府就应该被解散。当立定的法律被违反、或是代理人滥用权力时，一个政府便是背叛了其人民。当政府被宣告解散后，人民便有权再建立一个新的政府，以对抗旧政府的不正当权威，这种情况又可以称为“革命”。