索南达杰的死震惊了各界及舆论，中国政府于1995年批准成立“可可西里省级自然保护区”，并在1997年升格为“可可西里国家级自然保护区”。 自1995年前，由环保志工杨欣发起的“保护长江源，爱我大自然”活动多次前往可可西里地区，进行考察与参加建设保护站，并和札巴多杰连络，共同讨论保育藏羚羊的事宜，并寻求国际援助 。1998年，札巴多杰突然死亡（据说是在家附近遭受枪击） ，但西部工委的工作并未因此中断，直到2001年，西部工委爆发贪污丑闻，八名成员因为在执行任务中收受私款、放走歹徒，而被格尔木市检察院逮捕，西部工委被迫解散，其工作移交可可西里国家级自然保护区。
为了纪念索南达杰，可可西里保护区的第一个保护站便以他的名字命名，“索南达杰保护站”是可可西里地区建站最早、名气最大的的保护站，主要任务是接待游客与救治藏羚羊。