目前学术界对《企业的性质》一文的分析，大体思路是这样的，首先从总体上肯定科斯对交易费用理论和产权理论的贡献，但更从两个方面对其提出了批判。
一是企业的产生和存在的理由并不仅仅只是表现在交易费用的节约。人类的生产是一个人和人之间的协作的过程，完全独立的生产是不多见的。协作能够提高生产效率，能够完成单个人所不能完成的工作。如果一定要由家庭个体来制作，则生产费用一定会高很多。这部分高出的费用并不是由于谈判、签约的交易费用，而纯粹是生产中的耗费。 另外社会分工虽然能达到一定的程度，但它不可能象企业内部那样细致，企业的存在缩短了在制品的各个特殊生产阶段之间的空间距离。在制品从一个阶段转移到另一个阶段所需要的时间减少了，用在这种转移上的劳动也减少了。
所以，企业的出现并不仅只是科斯所说：交易费用的节约，或者说是寻找价格、谈判和签约的成本的降低，而更重要的是，企业能产生大大降低除交易成本之外的生产成本。 二是关于企业的规模的影响因素的争议。有学者认为，决定企业规模大小的因素不只是两种交易成本的对比，还有生产本身的原因。从三种情况即：规模收益不变，规模收益递增，规模收益递减。分别考虑企业规模的扩大对成本的影响。可能会出现生产规模扩大会使规模效率下降、不变或者上升的情况。