军机处和内阁的区别就在于，内阁的权力比军机处的要更大。

首先在出现时间上，军机处出现的时间比内阁出现的时间要晚，而内阁早在明朝时期就已经设立了。当然，军机处在设立的过程中，也将明朝的制度给继承了下来，只不过在这一过程中将其中的一个机构给退了下去，使清朝出现了军机处与内阁共存的现象。

军机处与内阁是有很大区别的，这其中最重要的区别就是内阁相对于军机处来说，拥有更多的实权。对于这种机构来说，没有权力，就等同于这个机构形同虚设，只是别人操作的棋子，任由其他人来进行摆布。而内阁作为明朝时候的重要机构，不仅拥有实权，且权力还比较大，比起只能为皇上处理政务的军机处，内阁的优势就更加明显，拥有更多的决策权。

当然，军机处也不是处处不如内阁，虽然军机处在参政议政上没有什么权利，平日里只能做些辅佐政务的活，但是军机处在内阁出现以后，也拥有一个非常重要的任务。那就是帮助皇帝监督内阁，避免内阁里面出现权力过高的行为，降低内阁造反的可能性，同时军机处还只能由皇帝调遣，为皇帝自己所用。

内阁的存在在我国历史上的政治体制中保留了很久，这种制度不仅能够很好地起到了参政议政，帮助皇帝进行决策的作用，而且还能够降低皇帝独揽大权的可能性，避免了皇帝做出错误的决定。但是内阁发展到后期，也在一定程度上威胁到了皇帝的权力，因此被在清朝时期逐渐地被军机处代替，最终成为了皇帝自己所能调遣的一个机构，这也反应了皇帝逐渐将权力收到自己手中的过程。

内阁是皇帝处理国政的助理机构，是明代设的，与军机处相比还有一点权力；
军机处是清朝色好的辅助皇帝处理政务的，完全只能秉承皇帝旨意办事，没有权力

在清朝是这样的：内阁是负责内政的、像什么吏部、工部、兵部等等只负责政治事务。军机处是国家最高军事机关，国家的军事情报他们最先知道的。出现情况是他们在一起讨论对策。但军机处大臣也有来自内阁的（像和申就是中堂兼军机大臣），也有专职负责军事的（像一些大将）军。

内阁在最初的时候只是秘书性质的机构，到明朝成化、弘治之际，内阁在已经成为足以对抗皇权的文官政府代表，万历早期应该是内阁权力极盛的时期，张居正改革让内阁成为政府运转的中枢，他的实际上已经接近于现代首相的地位

军机处只有跪受皇帝旨意的权利，实际上是个宣布皇帝命令的机构，但和皇帝较亲密

军机处从开始到结束完全无权（像电视里王刚演的和珅是什么军机大臣就是没权力的）
内阁到中后期权利变大（如杨廷和、张居正）

参议权，是指内阁成员有权力讨论国家大事，提出建议，但是没有权力表决和决定；参政权就不但有权讨论还可以提意见、表决了！

内阁制是在明朝永乐时期朱元璋建立的，其目的是为了加强皇帝的权利，收回宰相手中的权利。内阁刚开始只是助理机构，没有实权，后来内阁与宦官勾结，把持朝政，代替皇帝行使权力

建立：明太祖朱元璋废除丞相，但导致皇帝政务繁忙的弊端。明成祖朱棣设立内阁制，
以内阁作为皇帝处理政务的助理机构。

地位：内阁是皇帝处理政务的助理机构，始终没有取得法定的地位，职权范围不明朗，
不能正式统帅六部百司。

权力：明成祖成立内阁后，把决策权把持在手中，议政权分给内阁，行政权分给六部。

作用：1.明朝内阁制强化了君主专制制度。
2.宦官参政，妨碍阁权，甚至控制内阁，导致明朝政治日益黑暗。

内阁制是在明朝永乐时期建立的.
公元1402年,大明成祖永乐皇帝为了巩固权力,做出两个重大决定,一是把首都迁到自己的势力范围北京,二,成立内阁制,这样,一个国事咨询机构正式建立了.
过去,宰相拥有决策权、议政权和行政权,明成祖成立内阁以后,把原来宰相拥有的决策权牢牢把持在自己手中,议政权分给内阁,行政权分给六部.地方上分三司,分管司法、军事、行政,直接对六部负责.
在明成祖掌控之下,内阁与六部各司其职,国家最高行政命令从紫禁城发出,通过全国1936处驿站,全长143700公里的驿道,层层下发到帝国的每一个角落.
后来,大明宣宗朝时期形成了更为完善的政务流程：全国大大小小的奏章,甚至老百姓给皇帝提出的建议,都由通政使司汇总,司礼监呈报皇帝过目,再交到内阁,内阁负责草拟处理意见,再由司礼监把意见呈报皇上批准,最后由六科校对下发.
内阁大臣的建议是写在一张纸上,贴在奏章上面,这叫做“票拟”.而皇帝用红字做批示,称为“批红”.按照规定,皇帝仅仅批写几本,大多数的“批红”由司礼监的太监按照皇帝的意思代笔.以往,按大明祖制,太监读书识字是被严令禁止的.大明宣宗不仅改了这个规矩,而且在他的鼓励下,宫里还成立了专门的太监学堂.后人猜测：明宣宗这一做法,其目的就是让太监牵制内阁的权力.久而久之,一种奇怪的政治格局出现了.