原因特别简单，太子之所以拉帮结派，那就是对父亲的皇位有所觊觎，皇帝当然不希望有人觊觎自己的皇位，即使是自己的亲生儿子，即使是自己想要传位给他的人通通都不可以。并且一般来说太子拉帮结派，那就是造反的前一步，只要皇帝发现自己的太子拉帮结派。那么大多都会废太子。

比如说我们熟知的康熙和他的太子允礽，要说起来康熙对自己的这个儿子真的特别好，因为允礽的生母赫舍里皇后是康熙的原配。也是康熙这一生最为挚爱的女子。为了给康熙生下嫡子，赫舍里皇后难产而死，所以对于这个孩子康熙格外的看重，从允礽一小就带着自己的身边亲子教育抚养。古人都说慈母多败儿，其实慈父也多败儿，正是因为康熙对这个允礽特别好，所以在中后期允礽竟然开始拉帮结派，准备和索额图一起谋大事。

康熙晚年遭遇九子夺嫡，但实际上这并不是让康熙最为伤心的，他最为伤心的是这个自己一手带大的儿子竟然企图造反，觊觎自己的皇位。允礽和朝中大臣来往密切，尤其是和索额图，康熙都看在眼里，在两次废黜允礽的太子之位后，允礽最终无缘皇位。

即使不是太子，是普通的皇子拉帮结派皇帝也是不能容忍的。雍正创立了秘密立储制度，而雍正的皇子弘时也经常和朝中大臣一起拉帮结派，觊觎雍正的皇位，并且他拉帮结派的大臣还曾经是雍正的政敌，雍正当然很生气，于是先把他过继给了八爷，后来又直接把他削除了宗籍，直接不认他这个儿子。所以我们也不能看出皇帝对于自己的儿子拉帮结派，企图觊觎自己的皇位这种事情真的是零容忍，一旦发现绝不姑息。

熟读历史我们不难发现一个问题，古代太子迟早要登基为帝的，为什么皇帝不让太子结党？难道不是亲生的吗？古代帝王一边稳固皇权还要给太子权利从而形成两难的境地一个帝王想要治理一个国家，仅靠自己的能力是相当困难的，自然就会产生文臣武将，而在这些文臣武将之中不乏与自己亲近之人，也就是自己的心腹，这些心腹来源于上一代，有的来源于自己登基以后培养的人才。

帝王不但要有自己的心腹，还要培养自己下一代的心腹，也就是给太子培养一些可以治国安邦的人才，这样之下，太子他们形成了一个权利集团。当一个国家有两个权利集团之时，势必会形成权利分割，在权利被分割的同时，太子的权利集团就成了皇帝的心头大患。

一般皇帝就会做出一个举动，扶持几个其他儿子跟太子权利集团进行竞争，形成互相牵制作用，这样太子集团不会权利过大威胁皇权。可是这么做会形成两种局面，要么太子胜出，等皇帝百年之后顺利登基，可其他皇子的处境可想而知。要么太子的权利集团被皇帝扶持的皇子们反杀，被扶持的皇子登基。最好的一个局面就是太子胜出皇子们相安无事，可历史告诉我们，相安无事的少之又少。

这样帝王会陷入两难的境地，毕竟太子与其他皇子都是自己的心头肉，这样的权衡局势已经让帝王苦不堪言，所以太子断然不可继续结党势力过大，因为已经有帝王给予太子权利集团在压制其他皇子，倘若在结党，帝王不好掌控太子。

古代帝王年龄差距不大我们都知道古人结婚生子一般比较早，尤其是古代皇帝更早，有的皇帝在做太子的时候或者做皇子之时已然结婚生子，有的则十二三的年纪就有子嗣。登基为皇帝之后随着时间的推移，皇帝在壮年之时，自己的皇子已经成年。成年的皇子面对皇位的诱惑可想而知，可是此时的皇帝正值壮年，皇帝不龙驭归天，太子始终是太子。

此时就形成了一种尴尬的局面，皇帝壮年，太子成年，皇帝和太子之间成了互相提防的局面，皇帝怕太子等不及，一直在提防太子，太子倘若结党的话对皇帝可是一种威胁，严重的甚至危及皇帝的身家性命，皇帝在提防太子弑父谋反的情况下，皇帝自然不能让太子集结党羽。

古代皇帝怕太子结党成员为了权利蛊惑太子谋反都说忠君爱国和一心为民，真正做到的文臣武将少之又少，皇帝的权利集团也好，太子的权利集团也罢，集团成员无不为了权利和利益才会集结在一起。太子集团成员和皇帝集团成员为了权利和利益现在成了敌对局面，皇帝集团成员想让皇帝继续稳坐江山达到自己的利益不被分割，而太子集团成员恨不得太子马上继位好实现自己利益的最大化。加上太子和皇帝的年龄差距不大，再则谁能更长的待机还是个未知数，在这样的条件之下，太子集团成员会在有意无意之下来蛊惑太子赶快登基为帝，这样势必会出现太子谋反的场面，所以皇帝此时最怕的就是太子结党，毕竟本身已经为太子培养了一些人才，而这些人才蛊惑太子谋反的几率还可以控制，可太子在结党势必会在党羽的诱惑之下弑父谋反。

加上太子和皇帝的年龄差距不大，再则谁能更长的待机还是个未知数，在这样的条件之下，太子集团成员会在有意无意之下来蛊惑太子赶快登基为帝，这样势必会出现太子谋反的场面，所以皇帝此时最怕的就是太子结党，毕竟本身已经为太子培养了一些人才，而这些人才蛊惑太子谋反的几率还可以控制，可太子在结党势必会在党羽的诱惑之下弑父谋反。

虽然太子是皇帝亲生果肉，太子也会早晚登基，但作为权利最高的皇帝还是不允许皇帝有结党行为的。