1994年他与欧文·威尔逊合作拍摄了一部13分钟的黑白短片《瓶装火箭》，此短片得到了著名导演、制作人詹姆斯·L·布鲁克斯的关注，在他的帮助下，片子被送去圣丹斯电影节参展。1996年，由哥伦比亚公司出资将短片重摄扩展成了全长同名电影《瓶装火箭》。
安德森居住在纽约或洛杉矶，他的好友有电影人诺亚·鲍姆巴赫、索菲亚·科波拉和演员欧文·威尔逊。2004年，诺亚·鲍姆巴赫与安德森合写了剧本《水中生活》，而鲍姆巴赫的电影《鱿鱼和鲸》则是由安德森担当制片人。安德森经常与摄影师Robert Yeoman合作，在音乐方面，他则经常邀请Mark Mothersbaugh创作音乐。安德森的电影创作灵感也常常来源于他的朋友Stephen Dignan和Brian Tenenbaum。他的兄弟Eric会出演一些角色，也常在剧组帮忙，曾为安德森的电影《青春年少》拍摄花絮。
2005年，安德森为《鱿鱼和鲸》做制片人，这部作品是由诺亚·鲍姆巴赫编剧并导演的，电影在圣丹斯电影节上获得两个奖项（导演奖，编剧奖）。2006年，安德森导演为美国运通公司导演商业广告《我的生活，我的卡》。2007年，为AT&T公司拍摄商业广告。
2007年，欧文·威尔逊再次加盟安德森电影，拍摄《穿越大吉岭》。剧本由安德森、罗曼·科波拉、詹森·舒瓦兹曼共同创作。安德森还为《穿越大吉岭》拍摄了一个类似前传的13分钟短片《骑士酒店》，詹森·舒瓦兹曼照例是主演，并请来娜塔莉·波特曼友情出演。2009年，《穿越大吉岭》入围威尼斯国际电影节竞赛单元。这部表现小人物苦乐参半生活的影片充分显示了安德森古怪的冷面幽默和颇具个性的视觉风格，他始终保持着自己鲜明的个性和独立的精神，这些特点使他被称为新一代的比利·怀尔德。
2009年，安德森将罗尔德·达尔的经典童话改编成定格动画《了不起的狐狸爸爸》，获得了第82届奥斯卡金像奖最佳动画长片提名。
2021年，执导影片《月亮升起之王国》入围第65届戛纳电影节金棕榈奖主竞赛单元，也获得了开幕影片的殊荣。次年，凭此片获得第85届奥斯卡金像奖最佳原创剧本提名。
2021年，凭作品《布达佩斯大饭店》入围第87届奥斯卡金像奖最佳影片、最佳导演、最佳原创剧本等九项大奖。
对于下一部新作，韦斯透露是以狗为主人公的定格动画，新片会采取意大利导演维托里奥·德·西卡《那不勒斯的黄金》的多段式结构。