五年级的学生来克生活在城市的一座高楼里，没有朋友，感觉十分孤独。一天放学后，来克做完作业玩起了桌上的魔方，好长时间一直玩不好，他一急把魔方摔到了桌子上，这时候怪事发生了，魔方越来越大，最后成了一座城堡。
来克感到很惊奇，就进入了魔方大厦，魔方大厦共有26个方国。但是大厦里的每个方国都在不停的转动。来克在魔方大厦里参观了玻璃城，认识了乐乐乐；帮玩具树上的动物们恢复了生命，还参加了科洛赛马会，乘坐了火车国的火车去历险，……
整篇故事围绕着互帮互助，乐于助人的主题展开，每到一个方国，来克就利用自己的聪明才智为当地的人们做一些好事，受到了当地人的赞扬和爱戴，最后所有方国的人都出动帮助来克找魔方大厦的出口—玻璃城，最后聪明的锁国人为每一个方国都安装了可视电话，让来克轻松的找到了玻璃城，走出了魔方大厦。
皮皮鲁和魔方大厦》里的每一篇故事都有不同的教育意义：玩具树的主题是友爱、互助；装在罐头里的爸爸妈妈的主题是家长和孩子要互相理解和尊重；星座号提醒人们不要贪得无厌；瓜王葬礼的主题是爱别人才能得到别人的爱；
友爱、互帮互助是孩子们学习和日常生活重要的内容，一个有爱心的孩子将来才能成为有用之才，《皮皮鲁和魔方大厦》正是以一篇篇有趣的故事教育孩子们要有爱心，要互帮互助，只有这样你才能有更多的朋友，收获更多的快乐。